Sinds 2008 organiseert GroenLinks Amsterdam elk jaar een aantal denktanks. In een denktank werkt een groep mensen samen met een gemeenteraadslid aan een GroenLinkse oplossing voor een Amsterdams probleem. In een aantal maanden wordt een voorstel geschreven dat in de gemeenteraad wordt ingediend.
In september 2016 zijn zes denktanks van start gegaan. De onderwerpen zijn (1) Duurzame haven, (2) Autovrije binnenstad, (3) Deltaplan fiets, (4) Drukte in de stad, (5) Cameratoezicht vs. privacy en (6) Preventieve zorg.
In 2015 heeft de denktank 'Afval & Recycling' zich verdiept in het afval van de Amsterdammers.
In 2014 zijn er vanwege de gemeenteraadsverkiezingen geen denktanks georganiseerd. In 2013 waren er drie, over de volgende onderwerpen: